Sarah Connors mareritt begynner igjen når en ny og enda mer dødelig Terminator, T-1000, sendes tilbake i tid for å slå til mot John Connor som gutt. Men Sarha og John møter ikke farene alene. Motstandsbevegelsen sender Terminator tilbake i tid med ordre om å beskytte John Connor - og slaget om morgendagen er begynt.
Det er gått 13 år siden den første terminatoren ble utslettet. Nå sender man en enda mer avansert Terminator T-1000 tilbake i tid for å drepe John Connor som tidlig tenåring. Det blir en voldsom kamp på liv og død der John sammen med sin mor Sarah og en annen terminator, som er omprogrammert av John i framtiden og sendt tilbake for beskyttelse, må kjempe for å redde menneskeheten i framtiden...