Scrat er som vanlig "helt nøtt" til å få tak i den forbaskede eikenøtta han har jaktet på siden tidenes morgen, og denne gangen får det innvirkninger for hele verden. Kontinentkatastrofen blir begynnelsen på det største eventyret Manny, Diego og Sid noen gang har vært på. Etter omveltningene blir Sid gjenforent med bestemoren sin, og flokken treffer en gjeng med sjørøvere som vil gjøre alt for å hindre dem i å komme seg hjem igjen.
Ekornet Scrats evinnelige jakt på nøtta si skaper verdensomspennende konsekvenser når kontinentene deler seg. Også Manny, Diego og Sid blir dermed sendt ut på større eventyr enn noen gang.